Cristina: Para intentar ayudarte a solucionarlo necesito averiguar algunas cosas. Si puedes, respóndeme después de hacer las siguientes comprobaciones.
Si lo único que ha cambiado de color es toda una voz o unos compases concretos, es posible que sin querer la hayas seleccionado y movido de "capa" y que además tengas configurados diferentes colores (aunque hayas asignado el negro a la capa que utilizas normalmente). Si intentas modificar o borrar notas de una capa diferente de la que tienes activa (esquina inferior izquierda), el programa no te dejará.
- Prueba a escribir algo en uno de los compases afectados (sin borrar nada). Si te deja y las notas originales siguen presentes, están en otra capa. Elimina las notas que hayas escrito ahora.
- Para averiguar qué capa es la que contiene las notas coloreadas, prueba a seleccionar una capa diferente (2, 3, 4) en la esquina inferior izquierda e intenta ahora hacer algún cambio. Una vez lo has averiguado, deshaz todos los cambios con Ctrl-Z (o cierra el archivo y vuelve a abrirlo sin guardar nada).
- Para colocar la voz o compases erróneos, selecciona dichos compases y vete la opción "Copy/Move Layers" del menú Edit. Ahí tienes que mover el contenido de la capa que sea (2, 3 o 4) a la 1.
- Para terminar, si quieres puedes desactivar el uso de colores Edit/Program Options/Display Colors.
Espero que sea esta la causa. Si no es así o no funciona, dime en qué punto no va para intentar ayudarte mejor.
P.D.: Si quieres, envíame por mensaje privado el archivo de Finale y le echo un vistazo para intentar arreglártelo.